مسترکلاس بیوانفورماتیک رویداد آنلاین

​مهندسی ژنتیک وتولید پروتئین نوترکیب از تکنیک های بسیار کاربردی بیوتکنولوژی هم در تحقیقات و هم در صنعت جهت تولید پروتئین‌های نوترکیب با کاربردهای تشخیصی، درمانی، تحقیقاتی می‌باشد. با استفاده از مهندسی ژنتیک، طراحی و بهینه سازی سازه های ژنی جهت کلونینگ و بیان پروتئین پروتئین‌ها می‌توانند در حجم انبوه برای پاسخگویی به خواسته‌های فراوان صنعت تولید شوند.

​مهندسی پروتئین شامل دستکاری توالی های پروتئینی با هدف بهبود پایداری در برابر شرایط محیطی مختلف و ایجاد یک عملکرد جدید در پروتئین یا حذف یک عملکرد خاص می‌باشد. همچنین در این دوره فراگیران با آنالیز شبیه سازی دینامیک مولکولی به منظور پیش بینی رفتار ماکرومولکولها در محیط دینامیک و آنالیز نتایج آن که از تکنیکهای بسیار پر کاربرد در مهندسی پروتئین و طراحی دارو می‌باشد، آشنا خواهند شد. کسب این مهارت‌ها به افزایش توانمندی فراگیران، توانایی انجام پروژه‌های تحقیقاتی بدون نیاز به فعالیتهای آزمایشگاهی، غنی‌تر شدن و تسریع پروژه های تحقیقاتی، و تقویت رزومه کمک خواهد کرد.

​به صورت کلی در این مسترکلاس، دانشجویان و محققین عزیز با مهارتهای بیوانفورماتیکی پر کاربرد در مهندسی ژنتیک و پروتئین آشنا شده و ضمن ارائه توضیحات تئوری، با انجام پروژه های عملی مباحث را به صورت کاربردی خواهند آموخت.​

1. آشنایی با پایگاه‌های داده بیولوژیک
2. پایگاه های داده ژن (NCBI, GenBank، Ensemble) 

3. مبانی تئوری و عملی similarity و Homology

4. Alignment و آنالیز فیلوژنی 

5. کار با نرم افزار GeneRunner 

6. طراحی پرایمر برای انواع PCR و ارزیابی کیفیت آن 

7. طراحی و بهینه سازی سازه های ژنی برای کلونینگ و بیان پروتئین 

8. آشنایی با سطوح ساختاری پروتئین‌ها

9. آشنایی با پایگاه های داده توالی و ساختار پروتئین (Uniprot،Swiss-prot،EMBL،NCBI Protein،PDB) 

10. ارزیابی خصوصیات فیزیکوشیمیایی پروتئین (Expasy Tools) 

11. نمایش ساختارهای پروتئینی و جهش زایی (Pymol) 

12. مبانی تئوری پیش بینی ساختار سوم و داکینگ مولکولی

13. پیش بینی ساختار سوم پروتئین (Template-Based Modeling) با ابزارهای پر کاربرد 

14. ارزیابی کیفیت مدل های پروتئینی پیش بینی شده از ساختار سوم پروتئینی

15. پیش‌بینی برهمکنش پروتئین-پروتئین، و پروتئین-لیگاند (Molecular Docking) 

16. آنالیز نتایج داکینگ مولکولی 

17. اصول تئوری شبیه سازی دینامیک مولکولی  و تحلیل نتایج آن

در این کارگاه، دانشجویان و محققین عزیز با مهارتهای بیوانفورماتیکی پر کاربرد در مهندسی ژنتیک و پروتئین آشنا شده و ضمن ارائه توضیحات تئوری، با انجام پروژه های عملی مباحث را به صورت کاربردی خواهند آموخت.

کسب این مهارت‌ها به افزایش توانمندی فراگیران، توانایی انجام پروژه‌های تحقیقاتی بدون نیاز به فعالیتهای آزمایشگاهی، غنی‌تر شدن و تسریع پروژه های تحقیقاتی، و تقویت رزومه کمک خواهد کرد.​

با توجه به سرفصل‌های برنامه ریزی شده برای این مستر کلاس، پیش‌نیاز خاصی برای دوره نیاز نیست و از مباحث مقدماتی تا پیشرفته را دربر میگیرد.به همین جهت، دانشجویان و فارغ التحصیلان کارشناسی تا دکتری تخصصی رشته‌های زیر میتوانند در این دوره شرکت کرده و از آن بهترین بهره را ببرند.

-تمامی رشته‌های مرتبط با بیوتکنولوژی، علوم زیستی، علوم آزمایشگاهی،علوم پزشکی،شیمی و...